这篇笔记整理了根据项目实战来学习variant calling（SNP和InDel）的流程。

这篇笔记整理了在做基因组注释与变异检测时，常见目录结构与底层文件格式的含义。
主要覆盖参考基因组构建（BWA 索引、功能注释）、Fastq 原始测序数据、以及 VCF 变异结果文件中的关键字段。

在二倍体生物中，同源染色体上的等位基因并不总是以相同的强度进行转录。这种现象被称为等位基因特异性表达（Allele-Specific Expression, ASE）。

技术路线参考图。

notes and summary

I solved some problems when installing jdk and fastqc. But finally, I decided to use bioconda to install al softwares, which is pretty convenient!

This is a tutorial about how to install softwares in your directory.

Review and notes about the article above.

这款鸡尾酒美观又可口，醇和圆润。使用古典式酒杯，给人以厚重感的鸡尾酒。

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