这篇笔记整理了QTL的鉴定原理。

在二倍体生物中，同源染色体上的等位基因并不总是以相同的强度进行转录。这种现象被称为等位基因特异性表达（Allele-Specific Expression, ASE）。

这篇笔记整理了在做基因组注释与变异检测时，相关文件格式的含义。
主要覆盖参考基因组构建（BWA 索引、功能注释）、Fastq 原始测序数据、以及 VCF 变异结果文件中的关键字段。

这篇笔记整理了根据项目实战来学习variant calling（SNP和InDel）的流程。

这篇笔记整理了variant calling（SNP和InDel）的技术原理。

在双端测序（Paired-end Sequencing）中，测序得到的R1和R2确实并非总是完整的、无冗余的正反向序列。根据文库插入片段长度（Insert Size, $L_I$）与单端读长（Read Length, $L_R$）的比例关系，实际下机数据会出现以下几种典型情况。

记录了二代测序的原理。

记录了建库以及上机前的原理。